碱类消毒药包括氢氧化钠（烧碱）、生石灰及草木灰，它们都是直接或间接以碱性物质对病原微生物进行杀灭作用。消毒原理是：水解病原菌的蛋白质和核酸，破坏细菌的正常代谢，最终达到杀灭细菌的效果。

　　氢氧化钠对纺织品及金属制品有腐蚀性，故不宜对以上物品进行消毒，而且对于其它设备、用具在用烧碱消毒半天后，要用清水进行清洗，以免烧伤畜禽的蹄部或皮肤。

　　新鲜的草木灰含有氢氧化钾，通常在雨水淋湿之后，能够渗透到地面。常用对畜禽场地的消毒，特别是对野外放养场地的消毒，这种方法，既可以做到清洁场地，又能有效地杀灭病原菌。

　　生石灰溶于水之后变成氢氧化钙，同时又产生热量。通常配成10%~20%的溶液对畜禽饲养场的地板或墙壁进行消毒，另外生石灰也用于对病死畜禽无害化处理，其方法是在掩埋病死畜禽时先撒上生石灰粉，再盖上泥土，能够有效地杀死病原微生物。